1、進入潔凈工程的管理，包括對潔凈室工作人員進入，物料進入，各類設備的搬入以及相關的設備，管線的維護管理，應做到不得將微粒，微生物帶入車間。

2、操作管理技術，對室內人員的移動和動作，室內設備及裝修材料的選擇和清掃，滅菌等，盡可能減少，避免室內塵粒，微生物的產生，滯留，繁殖等。

3、嚴格實行潔凈工程各類設備，設施的維護管理，制定相應的操作規程，使得各類設備、設施按要求正常運轉，包括凈化系統，各類水、氣、電系統、生產工藝設備和工具等，以保障產品生產工藝要求和空氣潔凈度級別。

4、清掃，滅菌管理。對室內的各類設備，設施的清掃，滅菌以及方法，周期和檢查明確的規定，避免室內塵粒、微生物的生產、滯留、繁殖。

5、潔凈工程環境控制的內容包括：空氣凈化，潔凈建筑，與產品直接接觸的水或氣體或化學品和生產設備，工具等的污染物控制以及微粒振動、噪音、靜電的控制等。